Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc6D3YZP9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc6D3YZP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc6D3YZP9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc6D3YZP9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc6D3YZP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms