Protein–RNA interactions for Protein: D3YZF7

Vsig10l, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like, mousemouse

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10lD3YZF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsig10lD3YZF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsig10lD3YZF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsig10lD3YZF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsig10lD3YZF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms