Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam47eD3YWC7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam47eD3YWC7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam47eD3YWC7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam47eD3YWC7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam47eD3YWC7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam47eD3YWC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam47eD3YWC7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms