Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip3B9EHT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clip3B9EHT4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clip3B9EHT4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms