Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfia4B8QI36 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia4B8QI36 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms