Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm6133B2RY53 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm6133B2RY53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm6133B2RY53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6133B2RY53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6133B2RY53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms