Protein–RNA interactions for Protein: B1AXP3

Saxo1, MCG1697, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saxo1B1AXP3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Saxo1B1AXP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Saxo1B1AXP3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Saxo1B1AXP3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Saxo1B1AXP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Saxo1B1AXP3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Saxo1B1AXP3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Saxo1B1AXP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms