Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm438B1ASB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm438B1ASB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm438B1ASB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm438B1ASB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms