Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem238A9JSM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem238A9JSM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem238A9JSM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem238A9JSM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms