Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp4A4UUI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gbp4A4UUI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4A4UUI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp4A4UUI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp4A4UUI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms