Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc9bA3KGF9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc9bA3KGF9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc9bA3KGF9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc9bA3KGF9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms