Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Patl2A2ARM1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Patl2A2ARM1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Patl2A2ARM1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms