Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc173A0JLY1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc173A0JLY1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc173A0JLY1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc173A0JLY1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms