Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms