Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trbv26A0A0B4J1P5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trbv26A0A0B4J1P5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trbv26A0A0B4J1P5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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