Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933424G06RikA0A140LIP3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms