Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RhoP15409 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms