Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms