Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kif3aP28741 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kif3aP28741 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms