Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RhoP15409 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RhoP15409 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RhoP15409 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RhoP15409 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RhoP15409 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 371.8 ms