Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NclP09405 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NclP09405 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NclP09405 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NclP09405 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NclP09405 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NclP09405 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NclP09405 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NclP09405 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NclP09405 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NclP09405 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms