Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhoP15409 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhoP15409 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhoP15409 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhoP15409 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhoP15409 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms