Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atad1Q9D5T0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms