Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RhoP15409 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RhoP15409 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhoP15409 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms