Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms