Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r25W4VSP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r25W4VSP2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r25W4VSP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r25W4VSP2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms