Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc166S4R181 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc166S4R181 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc166S4R181 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms