Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp5Q9Z2P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms