Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn6Q9Z262 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn6Q9Z262 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn6Q9Z262 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn6Q9Z262 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms