Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccne2Q9Z238 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccne2Q9Z238 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccne2Q9Z238 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccne2Q9Z238 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccne2Q9Z238 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms