Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pf4Q9Z126 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pf4Q9Z126 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pf4Q9Z126 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pf4Q9Z126 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms