Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nr1h3Q9Z0Y9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms