Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb6Q9Z0T9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb6Q9Z0T9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb6Q9Z0T9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb6Q9Z0T9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms