Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Slfn1Q9Z0I7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slfn1Q9Z0I7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Slfn1Q9Z0I7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slfn1Q9Z0I7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slfn1Q9Z0I7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slfn1Q9Z0I7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slfn1Q9Z0I7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slfn1Q9Z0I7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slfn1Q9Z0I7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slfn1Q9Z0I7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms