Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cib1Q9Z0F4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cib1Q9Z0F4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib1Q9Z0F4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cib1Q9Z0F4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms