Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec2Q9WV35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apobec2Q9WV35 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Apobec2Q9WV35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apobec2Q9WV35 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms