Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a4Q9WV27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a4Q9WV27 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a4Q9WV27 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp1a4Q9WV27 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms