Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r49Q9WUF1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r49Q9WUF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r49Q9WUF1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r49Q9WUF1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms