Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfsf13bQ9WU72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms