Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acox1Q9R0H0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acox1Q9R0H0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acox1Q9R0H0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acox1Q9R0H0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acox1Q9R0H0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acox1Q9R0H0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acox1Q9R0H0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acox1Q9R0H0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms