Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Zeb2Q9R0G7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Zeb2Q9R0G7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Zeb2Q9R0G7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zeb2Q9R0G7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Zeb2Q9R0G7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Zeb2Q9R0G7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms