Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod2Q9R0B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod2Q9R0B9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plod2Q9R0B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plod2Q9R0B9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms