Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AmfrQ9R049 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AmfrQ9R049 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AmfrQ9R049 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms