Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc3Q9QZC1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc3Q9QZC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc3Q9QZC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc3Q9QZC1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms