Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PnckQ9QYK9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PnckQ9QYK9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnckQ9QYK9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnckQ9QYK9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms