Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxnb3Q9QY40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxnb3Q9QY40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Plxnb3Q9QY40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plxnb3Q9QY40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxnb3Q9QY40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms