Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan3Q9QY33 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan3Q9QY33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tspan3Q9QY33 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan3Q9QY33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan3Q9QY33 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms