Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn4Q9QXZ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn4Q9QXZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn4Q9QXZ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn4Q9QXZ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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