Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nufip1Q9QXX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nufip1Q9QXX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nufip1Q9QXX8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nufip1Q9QXX8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nufip1Q9QXX8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms