Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cbx8Q9QXV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cbx8Q9QXV1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cbx8Q9QXV1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cbx8Q9QXV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms